A cirurgia está indicada nos casos em que alterações anatômicas estão presentes, como na atresia de coana, hipertrofia de adenoides e no desvio de septo; quando massas tumorais benignas ou malignas obstruem a fossa nasal dificultando a respiração, como nas meningoceles, gliomas, cistos dermoides, pólipos coanais, nasoangiofibromas, papilomas, estesioneuroblastomas entre outros; quando há falha no tratamento clínico como na rinite, na rinossinusite crônica sem e com polipose nanossinusal para a desobstrução do óstio de drenagem dos seios paranasais, nas mucoceles, entre outros.